Existuje několik metod, jak změřit množství a složení probiotických bakterií v lidském těle, zejména ve střevním mikrobiomu. Přímé měření probiotik v těle samotném není možné, ale můžeme analyzovat jejich přítomnost prostřednictvím stolice, která odráží složení střevního mikrobiomu.
Hlavní metody měření
Testy střevního mikrobiomu
Nejrozšířenější metodou je analýza vzorku stolice, která poskytuje detailní pohled na složení střevních bakterií. V České republice jsou dostupné komerční testy od několika laboratoří včetně SYNLAB (test myBIOME), MyBioma, Harmonelo a dalších [1][2][3][4].
Tyto testy využívají molekulárně-biologické metody pro identifikaci bakterií:
16S rRNA sekvenování – standardní metoda, která analyzuje specifický gen přítomný v bakteriích a archea. Dokáže identifikovat bakterie na úrovni rodu, občas až na úroveň druhu [1][5][6].
Metagenomické sekvenování (Whole Genome Sequencing) – pokročilejší metoda analyzující veškerý genetický materiál ve vzorku. Poskytuje vyšší rozlišení a dokáže detekovat všechny druhy s relativní četností vyšší než 0,01% [1][7].
Průtoková cytometrie s fluorescenčními barvivy – umožňuje rychlé rozlišení živých a mrtvých bakterií pomocí barviv jako SYTO 9 a propidium jodid. Metoda poskytuje výsledky během 2 hodin na rozdíl od kultivačních metod, které trvají dny [8][9][10].
Co testy odhalí
Analýzy střevního mikrobiomu typicky poskytují informace o [1][2][3][4]:
- Diverzitě mikrobiomu (jak rozmanitý je váš bakteriální ekosystém)
- Poměru hlavních bakteriálních kmenů (Firmicutes, Bacteroidetes a další)
- Množství specifických probiotických skupin (laktobacily, bifidobakterie)
- Kondici střeva v procentech
- Enterotypu (dominantní bakteriální typ)
- Metabolických funkcích (metabolismus vitamínů, sacharidů, tuků)
Měření v jednotkách CFU
Probiotika se měří v kolonie-tvořících jednotkách (CFU – Colony Forming Units), které představují počet životaschopných bakteriálních nebo kvasinkových buněk, které se mohou množit a tvořit kolonie [11][12]. U suplementů probiotik se počet CFU pohybuje typicky od milionů po miliardy na dávku [13].
Ve střevě zdravého člověka se nachází přibližně 10¹³-10¹⁴ (10.000 až 100.000 miliard) bakterií, což představuje biomasu asi 1,5-2 kilogramy [14][15][16]. V tlustém střevě je koncentrace nejvyšší – 10¹⁰-10¹² buněk na 1 gram stolice [16].
Limitace testování
Je důležité si uvědomit některá omezení těchto testů [17][5]:
- Mikrobiom se neustále mění v závislosti na stravě, zdravotním stavu a dalších faktorech
- Jeden odběr poskytuje pouze momentální snímek
- Výsledky ze stolice nemusí plně odrážet situaci v celém trávicím traktu
- Některé bakterie nelze kultivovat v laboratorních podmínkách
- Testy identifikují typicky pouze rod nebo druh, zřídka konkrétní kmeny [5]
Detekce probiotik po užití
Výzkum ukazuje, že ne všechny užité probiotické bakterie jsou následně detekovatelné ve stolici. Studie zjistila, že po týdenním užívání probiotik byly E. coli a enterokoky detekovány ve vzorcích stolice v 57% a 67% případů, zatímco laktobacily a bifidobakterie byly s výjimkou jednoho případu nedetekovatelné [18].
Přesnost testování
Moderní metody dosahují vysoké přesnosti. Například nástroj vyvinutý na Mayo Clinic (Gut Microbiome Wellness Index 2) prokázal alespoň 80% přesnost v rozlišení zdravých jedinců od nemocných na základě analýzy střevního mikrobiomu více než 8.000 vzorků [19].
Testy střevního mikrobiomu tak představují praktický způsob, jak získat informace o stavu vašich probiotických bakterií, i když neposkytují absolutně přesné měření každé bakterie v těle. Pro interpretaci výsledků je vhodné konzultovat odborníka v oblasti výživy nebo gastroenterologie [2][3][4].
Citace:
[1] test střevního mikrobiomu myBIOME | laboratoře SYNLAB https://www.eshop-synlab.cz/mybiome/
[2] MyBioma – Test mikrobiomu https://www.mirapashop.cz/mybioma-test-mikrobiomu
[3] Test střevního mikrobiomu | Zdravá střeva https://zdravymikrobiom.cz/test-strevniho-mikrobiomu/
[4] Probiotika na míru https://catalog.harmonelo.com/probiotika-na-miru
[5] Gut and Microbiome Health Tests – The Facts https://www.optibacprobiotics.com/learning-lab/in-depth/gut-health/gut-microbiome-test
[6] Microbiome Sequencing https://eurofinsgenomics.eu/en/eurofins-genomics/material-and-methods/microbiome-sequencing/
[7] The Problem with Single-Method Microbiome Tests https://www.gdx.net/blog/2025/07/the-problem-with-single-method-microbiome-tests
[8] Quantification of live and dead probiotic bacteria in … https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19529931/
[9] Rapid quantification of live/dead lactic acid bacteria in … https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28357994/
[10] Flow Cytometric Approach to Probiotic Cell Counting and … https://www.beckman.com/resources/reading-material/application-notes/probiotic-cell-counting-flow-cytometry-analysis
[11] How Are Probiotics Measured? https://enzymedica.com/pages/how-are-probiotics-measured
[12] Probiotics – Health Professional Fact Sheet https://ods.od.nih.gov/factsheets/Probiotics-HealthProfessional/
[13] Nejlepší probiotika 2025: Jaké produkty jsou nejlepší na … https://www.svetfitness.cz/nejlepsi-probiotika/
[14] Gut microbiota https://en.wikipedia.org/wiki/Gut_microbiota
[15] Update of Probiotics in Human World: A Nonstop Source of … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7760123/
[16] PRoBioTiCS iN HuMAN NuTRiTioN – PLENARY LECTuRE https://journal.pan.olsztyn.pl/pdf-98717-30566?filename=30566.pdf
[17] Komerční analýza mikrobiomu https://www.mikrobiom-cms.cz/stanoviska-cms/komercni-analyza-mikrobiomu/
[18] Are probiotics detectable in human feces after oral uptake … https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17721765/
[19] Mayo researchers develop tool that measures health of a … https://newsnetwork.mayoclinic.org/discussion/mayo-researchers-develop-tool-that-measures-health-of-a-persons-gut-microbiome/
[20] Střevní Mikrobiom: Prebiotika vs Probiotika https://www.mastichashop.cz/strevni-mikrobiom-prebiotika-vs-probiotika/
[21] How active are the microorganisms in your yogurt? We … https://theconversation.com/how-active-are-the-microorganisms-in-your-yogurt-we-created-a-new-tool-to-study-probiotic-activity-and-made-it-out-of-cardboard-219284
[22] Mikrobiom – vnitřní supervelmoc https://www.dtest.cz/clanek-8500/mikrobiom-vnitrni-supervelmoc
[23] How to Assess in vitro Probiotic Viability and the Correct … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7062668/
[24] NGS analýza střevního mikrobiomu https://chromozoom.cz/mikrobiom/analyza/
[25] Často kladené otázky | Česká mikrobiomová … https://www.mikrobiom-cms.cz/pacienti-a-laici/casto-kladene-otazky/
[26] Střevní mikrobiom https://www.puravia.cz/strevni-mikrobiom/
[27] Probiotics: What They Are, Benefits & Side Effects https://my.clevelandclinic.org/health/treatments/14598-probiotics
[28] Probiotika nemusí být tak prospěšná, jak lékaři věří … – ČT24 https://ct24.ceskatelevize.cz/clanek/veda/probiotika-nemusi-byt-tak-prospesna-jak-lekari-veri-upozornila-studie-76310
[29] Criteria to Qualify Microorganisms as “Probiotic” in Foods … https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2020.01662/full
[30] Nezávislý test probiotik pro dospělé 2025 https://vitalpoint.cz/blog/clanek/nezavisly-test-probiotik-pro-dospele.html
[31] Pečovat o střevní mikrobiom (nejen) na dovolené se vyplatí https://www.mojelekarna.cz/clanky/pecovat-o-strevni-mikrobiom-nejen-na-dovolene-se-vyplati
[32] Impact of Host DNA and Sequencing Depth on the … https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2019.01277/full
[33] Current Capabilities of Gut Microbiome–Based Diagnostics … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8206793/
[34] Gut Microbiome (Poo) Testing https://gutscharity.org.uk/advice-and-information/health-and-lifestyle/testing/gut-microbiome-poo-testing/
[35] How Do You Sequence a Microbiome? 5 Steps Explained https://www.cosmosid.com/blog/how-do-you-sequence-a-microbiome-5-steps-explained/
[36] Machine learning-based meta-analysis reveals gut … https://www.nature.com/articles/s41467-025-56829-3
[37] Microbiological Testing of Probiotic Preparations – PMC https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9099753/
[38] Human Microbiome Analysis | Profile microbial … https://www.illumina.com/areas-of-interest/microbiology/human-microbiome-analysis.html
[39] Microbiome 101: Studying, Analyzing, and Interpreting Gut … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6391518/
[40] Quality assurance criteria for probiotic bacteria https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002916523065036
[41] Next-generation sequencing: insights to advance clinical … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8970668/
[42] Microbiome Testing 101 (Finally, a Reason to Mail Your Poop) https://seed.com/cultured/microbiome-testing-accuracy-guide/
[43] Gut Microbiome & Health Check | i-screen https://www.i-screen.com.au/tests/microbiome-test
[44] Microbiome Analysis using NGS https://www.thermofisher.com/hk/en/home/life-science/sequencing/sequencing-learning-center/next-generation-sequencing-information/microbiome-research/microbiome-analysis.html
[45] How Accurate Are Gut Microbiome Tests? What You Need … https://www.innerbuddies.com/blogs/gut-health/accurate-gut-microbiome-tests-guide
[46] Gut Microbiome Test and What It Reveals About Your Health https://zoe.com/learn/what-is-a-gut-microbiome-test
[47] A high-throughput and low-waste viability assay for microbes https://www.nature.com/articles/s41564-023-01513-9
[48] Near real-time enumeration of live and dead bacteria using … https://www.nature.com/articles/s41598-019-41221-1
[49] A simple colorimetric method for viable bacteria detection … https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/ay/d1ay01624e
[50] High Throughput Viability Assay for Microbiology – PMC https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9881960/
[51] Recent Methods for the Viability Assessment of Bacterial … https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9500772/
[52] Live and Dead Bacteria Counts of Different Yogurts Before … https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S247529912308280X
[53] How to quantify bacterial cultures – From CFU and OD … https://www.eppendorf.com/sg-en/lab-academy/life-science/microbiology/how-to-quantify-bacterial-cultures/
[54] In vitro selection criteria for probiotic bacteria of human origin https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0002916523065024
[55] A flow cytometry method for safe detection of bacterial … https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/cyto.a.24794
[56] New method could replace microbiology CFU assay https://www.europeanpharmaceuticalreview.com/news/188568/new-method-could-replace-microbiology-cfu-assay/
[57] A comprehensive review of probiotics and human health … https://www.frontiersin.org/journals/microbiology/articles/10.3389/fmicb.2024.1487641/full
[58] How do we know if a microbe is dead? https://isappscience.org/how-do-we-know-if-a-microbe-is-dead/
[59] Rapid and universal quantification of viable bacteria with … https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0023643823005777
